scpコマンド

しばらく使っていなかったら既に忘れかけていたので

shell> scp -r /local/path username@domain.name:/remote/path

これでフォルダごとアップロード.
一方ダウンロードは

shell> scp -r username@domain.name:/remote/path /local/path

パス指定順を逆にするだけ.